บุคคลวงการต่างๆ ของสิงคโปร์และผู้ำนำจากหลายประเทศทั่วโลกรวมกว่า 2200 คนเข้าร่วมพิธีศพซึ่งจัดขึ้นที่ศูนย์วัฒนธรรมมหาวิทยาลัยแห่งชาติสิงคโปร์ นายลี เซียน ลุง นายกรัฐมนตรี นายโทนี ตัน เค็ง ยัม ประธานาธิบดี นายโก๊ะ จ๊ก ตง รัฐมนตรีที่ปรึกษาสิงคโปร์ ตลอดจนผู้แทนวงการต่างๆ รวม 10 คนได้กล่าวไว้อาลัยในพิธี นายลี เซียนลุงกับนายโทนี ตัน เค็ง ยัมในฐานะตัวแทนสมาชิกครอบครัวและประชาชนสิงคโปร์มอบพวงหรีด หลังจากนั้น ทุกคนลุกขึ้นยืนไว้อาลัยท่ามกลางเสียงแตรทหาร หน่วย SCDF（Singapore Civil Defense Force） เปิดไซเรน เป็นสัญญาณให้มวลชนทั่วประเทศไว้อาลัยเป็นเวลา 1 นาที รัฐพิธีศพสิ้นสุดลงท่ามกลางเสียงเพลงชาติสิงคโปร์
หลังจากนั้น ครอบครัวของนายลี กวนยูได้จัดพิธีฌาปนกิจเป็นส่วนตัว
