อญาโตลลอฮ์ คาเมเนอี ผู้นำสูงสุดของอิหร่านระบุว่า การที่ทางการซาอุดีอาระเบียประหารชีวิตผู้นำชาวมุสลิมนิกายชีอะห์ เป็นอาชญากรรมร้ายแรง อีกทั้งเตือนว่าทางการซาอุดีอาระเบียจะเผชิญกับปัญหาใหญ่หลวง นายฮัสซัน โรว์ฮานี ประธานาธิบดีอิหร่านกล่าวว่า การกระทำของทางการซาอุดีอาระเบียล่วงละเมิดสิทธิมนุษยชน อีกทั้งฝ่าฝืนคำสอนของศาสนาอิสลามด้วย ทั้งนี้เกิดจากนโยบายแยกนิกายทางศาสนาและนโยบายสนับสนุนลัทธิก่อการร้ายกับลัทธิหัวรุนแรงแผ่ขยายอิทธิพลในภูมิภาคตะวันออกกลางตลอดจนทั่วโลก ที่ซาอุดีอาระเบียดำเนินมาโดยตลอด พร้อมกันนั้น เขาประณามผู้ก่อเหตุเผาสถานทูตซาอุดีอาระเบียประจำอิหร่าน ย้ำทางการอิหร่านจะรักษาความปลอดภัยของสถานทูตและสถานกงสุลต่างประเทศประจำอิหร่าน อีกทั้งสั่งการให้หน่วยงานที่เกี่ยวข้องของอิหร่านไล่จับผู้ก่อเหตุ
ประชาชนอิหร่านมีปฏิกิริยาอย่างรุนแรงต่อเหตุการณ์ดังกล่าวเช่นกัน เมื่อคืนวันที่ 2 มกราคมที่ผ่านมา ชาวเมืองเตหะรานจัดการชุมนุมประท้วงที่หน้าสถานทูตซาอุดีอาระเบียประจำอิหร่าน มีผู้ประท้วงหลายคนบุกเข้าสถานทูตและวางเพลิงในอาคารที่ทำการ คืนวันเดียวกัน ชาวเมืองมัสฮัด เมืองศักดิ์สิทธิ์ของชาวมุสลิมนิกายซีอะห์จัดการชุมนุมประท้วงที่หน้าสถานกงสุลซาอุดีอาระเบียประจำเมืองนี้ ฝ่ายตำรวจเตหะรานเผยว่า ได้จับกุมผู้ต้องสงสัยก่อเหตุวางเพลิงสถานทูตซาอุดีอาระเบียจำนวน 40 คน
